მადაგასკარის ახალ სერიაში ჩვენ გველის პინგვინების ახალი თავგადასავლები. ამჯერად არეულობა ზოოპარკში იწყება პოპკორნის გამო."მადაგასკარის პინგვინების" სიუჟეტი აგებულია თვითგამოცხადცებული კომანდოელების ირგვლივ : კავალსკის, შკიპერის, რიკოს და რიგითის, რომლებიც ყოველდღიურ საიდუმლო ოპერაციებს ასრულებენ ნიუ–იორკის ზოოპარკის ტერიტორიაზე, ზოგჯერ კი მეტროში და მიწისქვეშა კომუნიკაციებში ჩადიან. და მაშინ, როდესაც რაზმი დაიწყებს ფიქრს, რომ ქალაქი მათ კონტროლ ქვეშაა, მათ ახალი მეზობელი გაუჩნდებათ – მეფე ჯულიანი.